Минобороны совместно с военной прокуратурой осенью 2009 года проведут в комиссариатах серию антикоррупционных проверок. По данным ведомства, за год количество злоупотреблений должностными полномочиями среди комиссаров и их помощников выросло в пять раз — в общей сложности выявлено 259 случаев. Почти в два раза увеличилось количество взяток. Всего за год в военкоматах выявлено более 500 нарушений. 

Как пишет газета "Московский комсомолец", чаще всего комиссариаты выдают поддельные справки для получения военного билета и освобождения призывников от службы, присваивают офицерские звания и зачисляют в запас выпускников ВУЗов, не прошедших должной подготовки, и переводят новобранцев в "нужные" места службы.  

Одним из средств борьбы с коррупцией станет реформа российской армии, начавшаяся в октябре 2008 года. В рамках реформы в республиканских и областных военкоматах останутся только четыре офицерских поста, а в районах — должность военкома. К 2011 году предполагается сократить 200 тысяч офицеров и полностью ликвидировать институт прапорщиков и мичманов, насчитывающий около 160 тысяч человек.